研究人员提供了一个平台来加速开发血癌和其他疾病的治疗策略
通过 RNA 将 DNA 转化为蛋白质的过程远非简单。在参与蛋白质合成过程的几种类型的 RNA 中，有一些可能会在中途被编辑。在哺乳动物中，RNA 编辑主要涉及通过脱氨基作用将腺苷 (A) 转化为肌苷 (I)，这可能会产生广泛的影响。例如，A 到 I 的转换可以以不同的方式调节基因表达，并显着改变最终合成的蛋白质。
虽然 RNA 编辑是一个重要的生物过程，但它也是包括癌症在内的一些疾病的关键潜在机制。因此，科学家们创建了记录各种人体组织中 RNA 编辑位点的大型数据库。这些数据库可作为从 RNA 编辑组中识别潜在诊断或治疗靶点的有用平台，RNA 编辑组涵盖给定细胞或组织中所有经过编辑的 RNA 分子。不幸的是，目前还没有造血细胞 RNA 编辑的数据库。造血细胞的独特之处在于它们可以发育成所有类型的血细胞，包括红细胞、白细胞和血小板。
在《中华医学杂志》最近发表的一项研究中，由中国医学科学院马燕妮博士领导的研究小组着手解决这个问题。他们建立了一个名为“REDH”的新数据库，可以方便地访问健康和恶性造血细胞的 RNA 编辑组。
为了构建数据库，研究人员下载并分析了 29 名白血病患者和 19 名健康献血者的 RNA 测序 (RNA-seq) 数据。他们还包括来自 12 个小鼠造血细胞群的 RNA-seq 数据。他们使用一种称为序列比对的技术，准确地识别了造血细胞中超过 30,000 个 A 到 I 的编辑位点以及与造血癌症有关的近 50 万个编辑事件。
该数据库由四个主要模块组成：分化、疾病、丰富和知识模块。“每个模块都支持用户定义的过滤器，根据用户定义的设置动态生成表格，并且结果可供下载”，马博士强调道。分化模块包含有关小鼠细胞群中 A 到 I 编辑的详细信息，目的是帮助科学家阐明 RNA 编辑与造血发育之间的相关性。另一方面，疾病模块描述了来自两种不同类型白血病的约 50 个样本的超过 400,000 个 A-to-I RNA 编辑位点。它还整合了每个样本的临床和基因表达信息，允许灵活探索个体患者或群体的 RNA 编辑事件。
富集模块可用于探索 9,000 多个 RNA 编辑位点的功能目的。它将这些位点分类为“染色质组织”、“DNA 代谢过程的调节”和“染色体组织的调节”。该模块可以帮助研究人员将观察到的特征或症状与任何相关的 RNA 编辑事件之间的点联系起来。最后，知识模块包含经过实验验证的 RNA 编辑事件，这些事件已知会影响造血和造血癌症。
REDH 数据库将成为指导和加速 RNA 编辑及其与血细胞分化关系研究的有用工具。它可以让我们更深入地了解血癌，并为更好的治疗铺平道路。随着新发现的出现，团队计划对REDH进行维护和更新，正如马博士所说：“为了使数据库与RNA编辑领域的发展保持同步，我们将继续监测新发表的文献并扩大血液类型疾病已纳入数据库。” 着眼于未来，马博士总结道：“我们希望我们的数据库能够成为探索造血分化分子机制并确定白血病和造血系统恶性肿瘤潜在治疗靶点的宝贵资源。”
我们祝愿他们在 REDH 方面一切顺利，并回应他们希望找到关于血癌的见解和治疗方法的希望。
版权声明：本文由用户上传，如有侵权请联系删除！