加州大学戴维斯分校开发的软件分析可能导致心律失常的钙火花
加州大学戴维斯分校和牛津大学研究人员组成的团队开发了一种创新工具：SparkMaster 2。该开源软件允许科学家自动分析细胞中正常和异常的钙信号。
钙是所有细胞(包括心脏等肌肉)中的关键信号分子。新软件能够自动分析细胞中钙释放的不同模式。这包括钙“火花”，即与不规则心跳(也称为 心律失常)相关的心肌细胞内钙的微观释放。
Circulation Research上发表了一篇 展示 SparkMaster 2 功能的研究文章 。
该研究文章的第一作者Jakub Tomek是牛津大学生理学、解剖学和遗传学系的Henry Wellcome 爵士研究员。他在加州大学戴维斯分校完成了一年的研究金，与杰出教授 Donald M. Bers 一起工作。
“很高兴在最近的会议上展示 SparkMaster 2 并看到热烈的反响。我觉得这将是一个异常值，很少有人会关心。但许多人对拥有一个新的分析工具感到兴奋，该工具克服了他们所面临的许多限制对以前的工具有丰富的经验，”托梅克说。
加州大学戴维斯分校的奖学金导致工具更新
细胞如何以及何时释放钙的问题可能会对一系列疾病产生影响，包括心律失常和高血压。为了了解这些疾病背后的机制，研究人员使用荧光钙指示剂和显微成像来测量细胞水平的钙变化。
然而，生成的数据文件很大并且难以手动分析，因此定制的软件分析工具至关重要。
在加州大学戴维斯分校的 Bers 实验室，Tomek 与助理项目科学家Christopher Y. Ko讨论了分析工具。他们发现需要更好、更用户友好的软件，从而开发了 SparkMaster 2。
该新工具建立在 SparkMaster 的成功之上，该工具由 Bers 和 Eckard Picht于2007 年发布 。皮希特是一位医学科学家，曾与贝尔斯一起工作，先是在芝加哥洛约拉大学，然后在加州大学戴维斯分校工作了几年。当时，没有用户友好的免费软件可以分析钙火花(他们研究的关键部分)，因此他们开发了一款。
为了创建新软件 SparkMaster 2，Tomek 与加州大学戴维斯分校医学院药理学系的Bers、Ko、 Manuel F. Navedo和Madeline Nieves-Cintron合作。
尽管新界面的大部分内容与原始 SparkMaster 相似，但他们是从头开始编程的。使用Python(一种日益流行的开源编程语言)，他们能够利用许多现有的工具和库来创建他们想要的独特功能。
他们最终开发出一种软件，可以分析使用不同显微镜方法记录的钙火花，以及来自不同组织和转基因小鼠的细胞的钙火花。新版本的一些主要功能包括：
改进的用户界面
与以前的工具相比，识别钙释放事件的准确性更高
识别多种类型的钙释放事件的能力
能够准确地分裂和分析火花簇中的单个火花
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