TrackSig：通过肿瘤进化解开癌症的历史
肿瘤通常由不同的细胞组成，其中一些细胞随着时间的推移发生了变化或进化，并获得了生长更快、存活时间更长并有可能避免治疗的能力。这些具有“进化优势”的细胞被认为是导致绝大多数癌症死亡的原因，但研究人员现在有了一种应对肿瘤进化的新工具：TrackSig。
TrackSig 由唐纳利细胞和生物分子研究中心计算机科学和分子遗传学教授奎德莫里斯及其在 Vector Institute 和 OICR 的团队开发，是一种新颖的计算方法，可以绘制癌症的进化图从单个患者样本中提取病史，进而帮助研究人员阻止疾病的下一步发展。
“我们将测序与进化论和数学模型相结合，以了解癌症如何发展并适应抵抗治疗，”Yulia Rubanova 博士说。莫里斯实验室的候选人和该研究的主要作者。“这种理解为我们能够预测并阻止未来癌症患者的肿瘤演变奠定了基础。”
TrackSig 今天发表在《自然通讯》杂志上，与《自然》杂志及其附属期刊中与全基因组泛癌症分析项目(也称为泛癌症项目或 PCAWG)相关的近两打其他出版物一起发表。
“泛癌项目的工具和发现正在改变我们对癌症的看法，”莫里斯说。“我们发现了改进诊断和治疗的新机会，我们将继续努力在正确的时间为患者提供最好的治疗。”
以前的肿瘤进化研究侧重于识别患者样本中最频繁的变化或突变，其中最常见的突变代表肿瘤发展早期发生的变化，不太常见的突变代表最近的变化。取而代之的是，Morris 的 TrackSig 绘制了不同类型的突变随时间变化的图表，生成了比以往任何时候都更详细、更准确的肿瘤进化史图。
这种水平的分辨率使人们能够发现许多致癌基因变化早在疾病被诊断出来之前就发生了。
“对于某些卵巢癌等特殊病例，我们能够在患者出现任何症状前 10 到 20 年看到这些早期事件发生，”OICR 适应性肿瘤学负责人兼泛癌项目指导成员 Lincoln Stein 说委员会。“这为早期检测和治疗开辟了一个比我们想象的更大的机会窗口。”
凭借他们新的肿瘤进化详细图谱，研究小组计划进一步研究新的癌症治疗策略并设计能够更好地预测、预防和克服进化和耐药性的新疗法。
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