俄亥俄州立大学为阿尔茨海默病研究开发可搜索数据库

• 2024-07-17 15:47:14

摘要一个可搜索的数据库现已准备好帮助研究阿尔茨海默病。俄亥俄州立大学韦克斯纳医学中心和医学院的神经科学和生物医学信息学研究人员创建了这...

一个可搜索的数据库现已准备好帮助研究阿尔茨海默病。

俄亥俄州立大学韦克斯纳医学中心和医学院的神经科学和生物医学信息学研究人员创建了这个全面、用户友好的存储库。

这个免费数据库(称为ssREAD )在《自然通讯》在线发表的一篇手稿中进行了概述。

阿尔茨海默病是痴呆症最常见的病因，占痴呆症病例的 80%。根据阿尔茨海默病协会2023 年阿尔茨海默病事实和数据报告，目前估计有 670 万 65 岁及以上的美国人患有阿尔茨海默病。

该数据库将有助于研究阿尔茨海默病的病理学。病理学研究疾病的病因、发展、结构/功能变化和自然史。

人们越来越多地通过单细胞和单核 RNA 测序 (scRNA-seq 和 snRNA-seq) 和空间转录组学来探索阿尔茨海默病病理背后的分子特征。

“这些技术为在细胞和分子水平上探索阿尔茨海默病的发病机制和性别差异提供了新的思路。我们的 ssREAD 存储库提供了更广泛的阿尔茨海默病相关数据集，具有优化的分析流程和更高的可用性，”研究共同通讯作者、俄亥俄州立大学神经科学助理教授Hongjun “Harry” Fu 博士说道。

数据集

该数据库包含来自 67 项阿尔茨海默病相关 scRNA-seq 和 snRNA-seq 研究的 277 个综合数据集，总计 7,332,202 个细胞。该存储库还包括来自 85 项人类和小鼠研究的 381 个空间转录组学样本。

详细注释，包括细胞类型和空间层

差异基因表达与功能富集分析

空间变异基因和单细胞数据集的反卷积

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