癌症生物标志物数据并不多样化对代表性不足群体的免疫治疗患者有影响
研究人员在9月29日发表在《癌细胞》杂志上报道，高肿瘤突变负担 - 癌细胞内发现的突变数量 - 可能不会推广为不同癌症患者群体的准确生物标志物。 这些结果可能对免疫检查点抑制剂(ICIs)治疗的临床决策具有重要意义，免疫检查点抑制剂是一种免疫疗法。
“该研究确定了具有高肿瘤突变负担(TMB)的潜在技术问题，作为以前未被重视的不同人群中的生物标志物，”Dana-Farber癌症研究所和哈佛医学院的联合高级研究作者Alexander Gusev说。“对代表性不足人群的生物标志物研究对于确保在精准医疗时代将差异降至最低至关重要。
最近，ICI苯丙利珠单抗获得了食品和药物管理局的批准，用于治疗高TMB的实体瘤。由于TMB在临床决策中被采用，因此其对各种现实世界环境的可推广性是其作为生物标志物的有效性和实用性的先决条件。除了准确的TMB估计问题之外，了解TMB作为不同患者队列中生物标志物的可推广性至关重要，因为TMB高临界值是在对主要具有欧洲血统的白人患者的研究中建立的。然而，TMB-high分类在多大程度上概括为不同患者群体中的准确生物标志物在很大程度上是未知的。
为了解决这一知识差距，Gusev和纪念斯隆凯特琳癌症中心的联合高级研究作者Jian Carrot-Zhang分析了2000多名ICI治疗的常见实体瘤类型的患者的遗传祖先。他们评估了临床结局，如总生存期和ICI失败时间。“据我们所知，这是对遗传祖先，TMB和免疫治疗结果之间相互作用的最大分析，”Gusev说。
在两个独立的临床队列中，来自常用的仅肿瘤测序组的TMB估计将个体严重过度分类为TMB-high组，特别是在非欧洲人中。这种偏倚在亚洲或非洲血统的患者中尤为明显。根据结果，TMB高的错误分类预计将影响21%的欧洲血统患者，而亚洲或非洲血统患者的这一比例分别为37%和44%。
“如果这在一般患者群体中成立，它将对许多患者的治疗选择产生重大影响，”Gusev说。“重要的是要注意，这是一种纯粹的技术偏见。该研究提出了一种计算方法来校正仅肿瘤的TMB估计值，以及一种计算应广泛适用的校正的方法。
作为概念验证，作者接下来将他们的TMB重新校准方法应用于ICI治疗的非小细胞肺癌患者。TMB-high分类仅在欧洲血统中与改善结局显着相关，因此有必要在非欧洲血统人群中进行验证。“这并不意味着TMB不应该被用作非欧洲血统个体的生物标志物，但它确实意味着需要更多的研究和数据收集来确定用于优化治疗结果的精确阈值，”Gusev说。“我们也希望这能强调在不同人群中评估生物标志物准确性的更广泛重要性。
进一步的分析显示，MGA基因改变与欧洲人的总生存期和ICI失败时间延长有关，与非洲人的结局无关，与亚洲人的结局更差有关。“我们在一些个体驱动基因上观察到祖先特异性效应，这表明这种现象可能不是TMB独有的，但也适用于个体突变，并对其他靶向治疗有影响，”Gusev说。
一个重要的研究局限性包括两个队列中非欧洲人的样本量小。“加速从这些人群中收集数据和结果至关重要，这样我们才能更好地了解TMB和其他生物标志物如何有效地推广到所有患者，”Gusev说。“样本量限制了我们研究更多癌症类型，个体基因组改变和更细粒度的群体特异性效应的能力 - 所有这些都可能产生重要的额外见解。
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