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研究确定了小儿脑癌的新表观遗传变化

摘要 根据发表在《自然通讯》( Nature Communications ) 上的一项西北医学研究,研究人员已经确定了儿童脑肿瘤中以前未知的表观遗传变化组,

根据发表在《自然通讯》( Nature Communications ) 上的一项西北医学研究,研究人员已经确定了儿童脑肿瘤中以前未知的表观遗传变化组,这些变化可以作为新的治疗靶点并为患者提供替代治疗选择。

Xiao-Nan Li,医学博士,博士,Rachelle and Mark Gordon 癌症研究教授,西北大学 Robert H. Lurie 综合癌症中心成员,是该研究的资深作者。

小儿室管膜瘤是儿童第三大常见脑癌,目前复发率为50%,大多数患者最终会因治疗反应不佳而死于该病。

虽然癌症具有侵袭性且复发很常见,但与其他类型的脑肿瘤相比,肿瘤生长速度较慢,这为患者护理团队提供了一个小窗口来尝试不同的治疗策略,包括切除复发性肿瘤。李说,虽然手术和放疗可以帮助延长患者的生存期,但迫切需要更有效和更长期的治疗方案。

在当前的研究中,Li 的团队使用来自 10名接受过放射治疗并在 13 年内多次经历癌症复发的儿科患者的患者匹配的原发性和复发性室管膜瘤肿瘤组织样本,对 DNA 甲基化测序和 RNA 测序进行了 DNA 甲基化测序和 RNA 测序,以确定表观遗传改变。年期间。

Li 说,从这组独特的患者肿瘤中,研究人员开发了一组新的患者来源的原位异种移植小鼠模型,这对于提高对肿瘤生物学的理解和测试新疗法至关重要。

“室管膜瘤是一种非常有趣的肿瘤,与许多其他人类癌症不同,突变不是主要原因。在这种肿瘤中,我们称突变为‘沉默’,因为没有太多突变。变化主要发生在表观遗传学方面,这就是我们关注 DNA 甲基化的原因,”李说,他也是血液学、肿瘤学和干细胞移植科的儿科学教授。

使用异种移植模型,研究人员确定了三组独特的表观遗传突变。

第一组包括差异表达的基因,这些基因受潜在“驱动”DNA 甲基化区域 (DMR) 或包含不同 DNA 甲基化模式的基因组区域的调节,这些区域从原发性肿瘤转移到复发性肿瘤。

第二组包含差异表达的基因,这些基因受潜在的“助推器”DMRs 调节,这些 DMRs 仅在复发性肿瘤中发现。特别是,研究人员发现 PLEKHG1 基因在所有复发性肿瘤模型中均有表达,据李说,这表明该基因可能是一个潜在的治疗靶点。

在原发性肿瘤中发现的第三组突变是“复发的预测因子”,或者是一组表观遗传标记,可以帮助预测肿瘤是否具有高复发风险。李说,这些预测因素可以帮助提供者避免对患者进行不必要的治疗,这可能会导致未来出现进一步的并发症。

“小儿的大脑还在发育,如果你对他们过于苛刻,会延缓发育,降低生活质量。如果我们有任何方法可以预测和改善他们的生活质量,那是非常重要的,”李说。

此外,筛选这些驱动因素和促进因素可以帮助确定潜在的治疗目标和基于精准医学的治疗策略。

“重要的是要知道复发性肿瘤与原发性肿瘤并不完全相同——它们变化很大——对于这类研究,我们需要更多的合作。我们需要与尽可能多的医院和机构合作,”李说。

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