巨型蚕豆基因组终于测序
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2023-03-24 16:09:13
摘要 Vicia faba L ,通常被称为蚕豆或蚕豆,以其富含蛋白质的种子和农业产量潜力而闻名。它用于人类消费和动物饲料。它还在向更可持续的农业
Vicia faba L.,通常被称为“蚕豆”或“蚕豆”,以其富含蛋白质的种子和农业产量潜力而闻名。它用于人类消费和动物饲料。它还在向更可持续的农业系统过渡的背景下提供急需的生态系统服务。特别是,它能够通过与土壤细菌或真菌的有益相互作用来固定大气中的氮并获取养分,从而减少对肥料的需求。
重建蚕豆的基因组序列是一项挑战,因为它由 130 亿个核碱基组成,至少比人类基因组大 4 倍。蚕豆中的遗传信息仅在 6 对染色体上进行。单独的 1 号染色体(最长)就是人类基因组中 23 条染色体的总和。
尽管该基因组具有丰富的转座因子、高度重复和相似的 DNA 序列,但测序技术的最新进展使得获得高质量的组装成为可能。扩增和消除其中一些重复的速率失衡实际上已被确定为蚕豆基因组规模扩大的原因。
通过定量遗传方法和基因组数据挖掘,该联盟首次确定了控制这种豆科植物感兴趣性状的基因,例如种子大小。
这种现在可用的新资源开辟了新的研究前景,特别是通过相互比较豆科植物基因组。在对植物蛋白的高需求和农业实践变化的背景下,它还将促进与这些问题相关的性状的品种选择。
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