国际DNA数据库揭示了狗的多样性
由 Jeff Kidd 博士领导的国际科学家联盟 密歇根大学教授、瑞典乌普萨拉大学 Jennifer RS Meadows 和 Elaine A. Ostrander 博士 国立卫生研究院国家人类基因组研究所的研究人员正在使用前所未有的大型犬类 DNA 数据库来公正地研究我们毛茸茸的朋友是如何进化成我们所了解和喜爱的各种品种的。
发表在《基因组生物学》杂志上的一篇新论文概述了 Dog10K 项目对来自 321 种不同品种的狗、野狗、郊狼和狼的近 2000 个样本进行基因组测序，并将它们与一个参考样本进行比较后发现的结果。一只名叫米施卡的德国牧羊犬。
他们分析了超过 4800 万条遗传信息，发现每个品种的狗都有大约 300 万个单核苷酸多态性差异。这些单核苷酸多态性(SNP)或“剪断”是人类和狗之间大部分遗传变异的原因。他们还发现了 26,000 个在德国牧羊犬中存在但在比较品种中没有的删除序列，以及 14,000 个在比较品种中存在但在米施卡的 DNA 中缺失的序列。
“我们进行了一项分析，看看这些狗彼此之间有多相似，最终我们可以将它们分为大约 25 个主要组，这些组几乎符合人们根据品种起源、狗的类型所期望的组别。 、大小和颜色，”密歇根大学医学院人类遗传学、计算医学和生物信息学教授基德说。
他补充说，大多数不同的基因都与形态有关，这证实了品种差异是由狗的外观驱动的。
相对于狗，狼的变异大约多出 14%。野生乡村狗(生活在村庄或城市的人们中但不作为宠物饲养的狗)比品种狗表现出更多的遗传变异。
该数据集是使用密歇根大学五大湖高性能计算集群进行处理的，还揭示了异常数量的逆转录基因，这是一种当 RNA 转回 DNA 并插入基因组不同位置时形成的新基因。研究发现了 926 个逆转录基因，基德说，其中最著名的是一种名为FGF4的逆转录基因，它会导致腊肠犬和柯基犬出现短腿表型。
基德说：“狗的逆转录基因数量往往会增加，从而导致被选择的突变，也许人们会觉得它们很可爱，并繁殖更多的狗。” 他的实验室正试图找出为什么逆基因和插入在狗身上如此频繁地发生。
Dog10K 联盟的好处之一是其规模，这将使密歇根大学和其他地方的研究人员能够检查其他犬类特征甚至狗的常见疾病(例如癌症)的遗传基础。
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