俄克拉荷马大学工程师获得NIH资助用于设计研究癌症发生的算法

MARMAR MOUSSA 博士获得了国立卫生研究院的资助。她的研究将使用空间转录组学，这是一种研究复杂细胞环境并提供组织环境中单个细胞的分子概况的技术。

俄克拉荷马大学计算机科学助理教授Marmar Moussa 博士获得了国立卫生研究院颁发的近 100 万美元的奖金，以推进她在计算基因组学方面的工作。

这项名为“人类结肠癌发生锯齿状途径的计算方法”的研究旨在利用有助于解释结肠癌如何发展的计算方法来揭示驱动人类结肠癌发生锯齿状途径的机制。

“由于结肠癌发生的复杂性，这项研究至关重要。结肠癌通常通过多种机制起源，包括导致异常病变(称为前体病变)的突变和基因变化，”穆萨说。“其中一些病变，例如增生性息肉，已被充分了解并且风险很小。然而，其他的，如锯齿状病变，仍然知之甚少，需要深入研究。”

穆萨说，锯齿状病变的特点是其独特的微观外观，呈现出独特的锯齿状图案。她的研究开发了计算方法来模拟此类病变进展为肿瘤的过程，这一过程称为癌发生。通过检查这些区域的 RNA 分子并识别特定特征，她希望阐明这些病变如何演变，最终导致癌症。

该研究将使用空间转录组学，这是一种研究复杂细胞环境的技术，并将提供组织环境中单个细胞的分子特征。穆萨说，这项技术使科学家能够更好地了解细胞在组织内如何相互作用、它们的空间排列以及它们在癌症发展中的作用。“通过空间转录组学生成的数据，我们可以识别与病变演变相关的复杂模式和特征。”

尽管结直肠癌的预防取得了进展，但它仍然是癌症相关亡的第二大原因。Moussa 指出，以锯齿状病变为特征的结肠癌发生的替代锯齿状途径由于其复杂性和缺乏全面数据而尚未得到充分研究。

穆萨说：“该研究项目不仅增进了对结肠癌的了解，而且有可能影响其他癌症类型的研究。”

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