优先考虑药物发现的人类相互作用组
Open Targets、EMBL 的欧洲生物信息学研究所 (EMBL-EBI) 和 GSK 的科学家们正在使用相互作用的人类蛋白质图谱揭示疾病的共同基础。通过帮助了解生物过程如何影响人类特征和疾病，这项工作将优先考虑药物发现的新目标并确定药物再利用机会。
蛋白质是在我们的细胞中完成大部分工作的分子，并且是按照基因编码的蓝图制造的。它们对于身体组织的结构、功能和调节至关重要，并且通常是药物或疗法的目标。
全基因组关联研究 (GWAS) 通过将特定基因与疾病联系起来，帮助我们建立疾病的遗传基础。为了确定这些基因如何导致疾病，我们需要了解它们编码的蛋白质的功能并将特定的生物过程与疾病联系起来。
在这项发表在《自然遗传学》杂志上的新研究中，研究人员创建了一个相互作用蛋白网络——或相互作用组——结合来自不同来源的证据，包括 EMBL-EBI 的IntAct 数据库、Reactome和Signor。使用这种相互作用组，他们确定了与基因相互作用的蛋白质组，这些基因已通过 GWAS 与来自 21 个治疗领域的 1,000 多种人类特征相关联。
因联想而内疚
相互作用的蛋白质可能会参与相同的生物过程。因此，如果已知一种蛋白质与某种疾病有关，那么了解它与哪些伙伴相互作用可以提供有关它在细胞中所具有功能的信息。通过“关联内疚”，相互作用的蛋白质有时也可以成为极好的治疗靶点。
研究人员发现了 73 个与不止一种性状或疾病相关的蛋白质簇，这种现象称为多效性。了解这些多效性关系对于药物发现来说是无价的，因为它们表明了一种疾病的治疗可能对另一种疾病有效的机会。他们还可以建议避免使用药物靶点，因为靶向这些靶点可能会导致不必要的副作用。
Open Targets 和 EMBL-EBI 的博士后研究员 Inigo Barrio Hernandez 说：“相互作用组确定了一些已知的关联，例如心血管疾病和脂蛋白或胆固醇测量。” “但我们也发现了一些意想不到的关联。例如，相互作用组突出显示了十种呼吸道和皮肤免疫相关疾病共有的三个蛋白质簇。这非常令人兴奋，因为我们现在有一些生物学支持来重新利用已被证明是安全的现有药物治疗相关疾病。”
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