通过下一代测序揭示中国南方地中海贫血的多样性
全球约 5.2% 的人口携带异常血红蛋白基因 [1]。全世界每年有 300,000 至 500,000 名儿童出生时患有严重的血红蛋白病，其中约 80% 的病例发生在发展中国家 [2]。地中海贫血是最常见的遗传性血红蛋白病，每 10,000 名活产儿中有 4.4 人患有地中海贫血 [3]。流行于地中海沿岸地区、非洲、中东、东南亚和中国南方。
此前的研究表明，江西省最南端的赣州市地中海贫血患病率高达9.49%[4]。尽管如此，它仍然存在样本量小、人群不具有代表性和突变谱有限等局限性。Tong Yang、Xuemei Luo、Yanqiu Liu、Wenqian Zhu(华大基因、临床研究高级经理)等人的一项新研究。2023 年 8 月 18 日发表在《人类基因组学》上的文章根据涉及 136,312 人的大规模地中海贫血筛查项目，研究了赣州地中海贫血的患病率和突变谱。
方法：
在本研究中，研究人员对参与《赣州市地中海贫血免费基因检测实施计划(2019-2022年)》的136312人进行了回顾性分析。
主要发现：
1.共发现19,827例(14.545%)地贫携带者，其中α地贫携带者14,298例(10.489%)，β地贫携带者4,921例(3.610%)，α和β地贫混合携带者608例(0.446%)。
2.共鉴定出156种不同的地中海贫血基因型，其中包括40种α-地中海贫血基因型、42种β-地中海贫血基因型和74种α-/β-地中海贫血组合基因型。鉴定出48种罕见的地中海贫血突变，如5'UTR +43至+40(-AAAC)、中国Gγ+(Aγδβ)0、-THAI、αfusion、-50 G > A和Hb Phnom Penh。
3.闽、粤、赣三省交界处的赣东南地区地贫患病率较高。其中，定南语和寻乌语的患病率较高，分别为18.3%和17.7%。
4. 新一代测序(NGS)技术比传统的地中海贫血基因筛查方法表现更好，特别是在识别新型或罕见的地中海贫血突变方面。受限于血液学分析灵敏度低以及聚合酶链式反应(PCR)的缺点，传统筛查方法会漏诊或误诊大量新型或罕见的地中海贫血变异。NGS 也是一种经济高效的产前筛查工具。
本研究通过NGS进行大规模地贫筛查，揭示了赣州地贫的患病率和突变谱，表明地贫是该地区严重的公共卫生问题。该研究结果对于赣州等地贫高发地区的防治具有重要意义。更重要的是，罕见和新颖变异的鉴定凸显了选择NGS进行大人群地中海贫血筛查的必要性和意义。
本研究经赣南医科大学第一附属医院伦理委员会批准。
版权声明：本文由用户上传，如有侵权请联系删除！