只需几分钟就能计算出蛋白质如何与药物相互作用吗
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2024-02-26 16:14:30
摘要 捷克科学院有机化学和生物化学研究所的一个研究小组开发了一种新颖的计算方法，可以准确描述蛋白质如何与潜在药物分子相互作用，并且只需几...
捷克科学院有机化学和生物化学研究所的一个研究小组开发了一种新颖的计算方法，可以准确描述蛋白质如何与潜在药物分子相互作用，并且只需几十分钟即可完成。因此，布拉格 IOCB 的这种新的量子力学评分功能可以显着加快新药的搜索速度。有关该主题的科学文章已发表在《自然通讯》杂志上。
该研究表明，这是同类方法中第一个普遍适用的方法。来自布拉格 IOCB 的计算专家在十种结构复杂程度不同的蛋白质上进行了测试，每种蛋白质都结合了多种小分子(通常称为配体)。然后，他们不仅将他们的结果与其他相应方法的结果进行了比较，而且还与实验室实验的结果进行了比较，两次比较的结果都非常好。
“当然，我们并不是唯一致力于此的人。有几种这样的方法。然而，通常，它们的速度会被低精度所抵消，而更准确的计算可能需要几天的时间。我们的方法是独一无二的，因为它们可以在数十分钟内处理有关大分子系统的信息，同时保留要求更高的量子力学计算的好处，”该文章的通讯作者、非共价相互作用 小组的Jan Řezáč解释道。帕维尔·霍布扎教授。
该小组的专家长期以来一直在研究分子间相互作用。在这项研究中，他们主要关注生物分子，其工作成果直接影响药物的计算机辅助设计。原因是，当科学家研究新药时，他们经常寻找与特定蛋白质牢固结合的分子。然而，识别它们就像大海捞针一样，因为必须测试大量分子才能区分出那些有希望的分子。这大大减慢了药物的发现速度并使其更加昂贵。通过预测蛋白质与配体结合的强度，从而选出最能满足一组定义标准的分子，计算化学家可以节省实验人员的工作，从而显着加速药物发现。
这项研究的潜力如此之大，以至于得到了商业部门的支持，布拉格IOCB的专家已经与世界上最大的制药公司之一合作了一段时间。
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