单细胞RNA seq揭示了激活蛋白C对阿尔茨海默病的转录组调节
一篇新的研究论文发表在Aging杂志上(MEDLINE/PubMed列为“Aging (Albany NY)”，Web of Science 列为“Aging-US”)第16 卷第 4 期，标题为： “单细胞 RNA-seq 揭示了激活蛋白 C 对阿尔茨海默病的转录组调节。”
单细胞 RNA 测序揭示了阿尔茨海默病 (AD) 模型 5xFAD(5x 家族性 AD 突变)与野生型 (WT) 小鼠相比细胞群的变化。在这项新研究中，来自南佛罗里达大学、密西西比大学医学中心和GV (Sonny) Montgomery VA 医学中心的研究人员Mohammad Kasim Fatmi、Hao Wang、Lily Slotabec、Changhong Wen、Blaise Seale、Bi Zhu和Ji Li利用单细胞RNA测序和生物信息分析分析APC[活化蛋白C]治疗对AD转基因小鼠的影响。
“在我们的研究中，我们利用了表达五种主要淀粉样蛋白病理的转基因小鼠，这些病理可导致 AD 和 Aβ 沉积快速进展，称为 5xFAD 小鼠。”
返回的测序数据通过10x Genomics CellRanger平台进行比对，形成相应的矩阵进行生物信息分析。与 WT 相比，5xFAD 中的胶质细胞发生了变化，特别是 5xFAD 中小胶质细胞增殖的增加是显着的。 5xFAD 与 WT 中神经胶质细胞的差异表达测试揭示了基因调控。在全球范围内，与 AD 进展有关的关键基因上调，例如 Apoe、Ctsb、Trem2 和 Tyrobp。
利用这些差异表达数据，完成了 GO 术语富集，以观察 AD 进展影响的可能生物过程。利用具有抗炎和细胞保护作用的重组激活蛋白 C (APC)，研究人员发现，除了恢复神经系统过程之外，APC 治疗还可以下调炎症过程。此外，动物研究表明，给予重组 APC 可以显着减轻 Aβ 负荷并改善 5xFAD 小鼠的认知功能。
“5xFAD 中高表达 AD 生物标志物的下调可以深入了解 APC 管理使 AD 受益的机制。”
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